近日，深圳市仙湖植物园的研究团队与合作者使用转录组数据首次对苔类植物目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树，对苔类植物的系统分类和演化研究具有重要意义。相关成果以在线形式发表于国际著名期刊《Annals of Botany》上。
苔类(liverworts)是植物界的一个门，属于苔藓植物三个主要分支(苔、藓、角苔)之一，其起源历史可追溯至4亿年前。作为一个古老的植物类群，苔类植物多样性却非常丰富，其深层次系统演化关系尚有很大争议。
近年来，随着高通量测序技术的发展，植物系统发育基因组学获得了快速的发展，转录组数据被广泛应用于植物系统发育基因组学中。研究人员取样了55个苔类的转录组数据，覆盖苔类15个目中的14个目，构建了1480个单拷贝核基因矩阵，首次对苔类目级系统框架进行了重建，得到了高支持的系统发育树。
虽然苔类骨架系统关系获得了高支持，其深层系统关系在单个核基因之间依然存在广泛的冲突。此外，细胞器基因组数据与核基因组数据之间也存在冲突信号，暗示了苔类植物在演化过程中可能存在古老的杂交事件，其基因演化过程中存在不完全谱系分选的现象。苔类是陆地植物中少有的在其深层演化中没有发生全基因组复制的大分支，此现象产生的原因及其背后的意义值得进一步的探究。
该论文第一作者为深圳市仙湖植物园南亚热带植物多样性重点实验室董珊珊副研究员，通讯作者为刘阳研究员。仙湖植物园张力研究员、深圳华大生命科学研究院联合培养研究生余进博士、美国康涅狄克大学Bernard Goffinet教授共同完成了该项工作。该研究得到深圳市城市管理和执法局科研专项基金的支持。(记者 文灿 通讯员 张力)
